進行系統分析時，首先要明確問題的性質、劃定問題的范圍。由于問題通常是在一定的外部環境的作用下和系統內部發展的需要中產生，只有明確了問題的性質和范圍，進行系統分析時才有可靠的起點；其次，還要研究問題的要素及其相互關系，研究要素與環境的關系，進一步劃清問題的界限。

    2.第二步，確定目標

    為了解決問題，要確定具體的目標。物流系統的目標通過一些指標來表達，指標是衡量目標達到的尺度。物流系統分析是針對所提出的目標來展開的，由于實現系統功能的目的是靠多方面因素來保證的，因此系統也會有若干個目標。如物流系統的目標包括物流費用、物流服務水平等，而其總的目標是以低的物流費用，獲得最好的物流服務水平。

    3.第三步，收集資料，提出方案

    建立系統模型或提出方案，都必須有資料作為依據，方案的可靠性論證更需要有精確可靠的數據，為系統分析做好準備。收集資料通常較多地借助于調查、實驗、觀察、記錄及引用國內外同類型資料等。

    4.第四步，建立模型

    建立模型就是找出說明系統功能的主要因素及其相互關系。由于表達方式和方法不同，模型有圖式模型、模擬模型、數學模型等。通過建立模型，可以確認影響系統功能和目標的主要因素及其影響程度。確認這些因素的相關程度，總目標和分目標的達成途徑及其約束條件。

    5.第五步，系統的最優化

    系統的最優化是運用最優化的理論和方法，對若干替代方案的模型進行仿真和優化計算，求出幾個替代解。

    6.第六步，系統評價

    根據系統優化得到的有關解，在考慮前提條件、假定條件和約束條件后，在總結實踐和知識的基礎上決定最優解，從而為選擇最優的系統方案提供足夠的信息。